Если говорить не о массовых эпидемиях, а про индивидуальные болезни, то вспоминаются Космические рейнджеры. Там часть заболеваний не просто снижают показатели, но и наглядно визуализированны. При ослеплении все объекты в космосе становятся прозрачными и еле видны, от фанатизма все дружеские корабли и оборудование визуально заменяются доминаторским, а от Чекумаша навыки хоть и не падают, но в игре начинают появляться фантомные объекты-пасхалки (можно увидеть звезду смерти например). Прикольно и то, что часть заболеваний можно обратить себе в пользу, когда одни навыки падают, другие наоборот возрастают. Ты не можешь эффективно стрелять, зато повышается умение торговать. Или из фонда изучения конкретного заболевания тебе переодически присылают деньги.
Ну и лором это нормально обусловлено. Часть болезней появляется просто так, как часто и бывает в жизни - раз и заболел на ровном месте. Но часть из них возникает от напряженных боев и длительного пребывания в космосе или чрезмерного потребления стимуляторов. Иммунитет не железный