На первый взгляд V3 мало отличается от предыдущих частей, у нас снова 16 (8 мальчиков и 8 девочек) подростков, страдающих амнезией и запертых в изолированном от внешнего мира месте (в этот раз это опять школа). Каждый из них обладает исключительным талантом в какой либо области: игра на пианино, боевые искусства, антропология, косплей, в таком духе. Их встречает Монокума (маскот серии - обаятельный робомедведь и маньяк, по мемности сравним с куклой из пилы), предлагающий сыграть в игру, которая представляет собой разновидность "Королевской битвы", но более утонченную. В отличии от неё, здесь не требуется убивать прям всех, достаточно одной жертвы, но дело осложняется тем, что убить надо максимально беспалевно, так как после обнаружения трупа начинается суд, присяжными в котором выступают сами же школьники. Если по его итогам удастся правильно определить виновного, то убийцу ждёт изобретательная и мучительная казнь, а игра продолжится. Если же злодей сумеет запутать и обмануть следствие, и вердикт окажется ошибочным, то казнят уже всех его неудачливых одноклассников, он же выходит на свободу.