как удобнее, так и собирай. только не забывай предварительно смотреть на крепление кулера: некоторым надо свой бекплейт вешать, а это удобнее делать, когда мать ещё не в корпусе.

Правильнее как удобнее будет. По мне лучше все на матери сделать, а потом ее в корпус целиком воткнуть, и все, не надо рученки пихать в корпус потом.