Весь этот сериал представляет собой цикл-симуляцию уже произошедших событий. "Исходная Мэдди" 43 млн лет назад пережила страшные события. В раздумьях, как быть, она решила воссоздать всё и повторить. Скажем так, взять атомы и сложить из них ту же картину в том же порядке, что и была, в надежде изменить судьбу. Естественно для этого понадобилась загрузка и 117 649 лет упорной работы по созданию многомерной симуляции Земли.
Все исходные данные в виде ДНК она взяла, пока была на земле. ДНК долго хранится, можно даже трупы раскопать или волосы старые найти, было бы желание и возможности. А также, она сумела на основе текущей ДНК воссоздать её эволюцию в обратном порядке и получить ДНК предков и первых видов людей. Тем самым у неё появилась возможность воссоздать всю историю Земли. Люди - это очень сложная, но всё же вполне читаемая комбинация, атомов и частиц, поэтому сверх-разуму было несложно воссоздать копию людей. Гораздо сложнее привести их к нужному результату, при этом не вмешиваясь.
Именно поэтому понадобилась сфера Дайсона, как мощнейшая вычислительная система и миллионы вариантов развития одного мира. Нужно было добиться идеального совпадения.
Но Мэдди всё же вмешалась один раз. Выбрав наиболее удачные миры, она отправила туда отца, чтобы подтолкнуть Каспиана к верному выбору. Увеличить шансы. Сделала все максимально аккуратно, и в самом конце, где знание Каспиана о том, что отец Мэдди жив, уже особо не влияло на концовку.
В итоге, как вам известно, она получила нужный результат. Но она по прежнему не понимала, как Каспиан мог знать будущее...
Ответ даёт "Оберег". Из его ответа можно понять, что уже 43 млн лет Мэдди повторяет одну и ту же, самую удачную, симуляцию. Каждый раз стирая память и начиная сначала. Получается примерно 365 попыток.
Есть интересный момент, когда Мэдди, после общения с "Оберегом" делает вывод, что где-то на них смотрит другая "реальная" Мэдди. И получается, что она сама как бы копия. Однако это скорее всего ошибочный вывод, так как подобная бесконечная цикличность рано или поздно перегрузила бы процессор. Так как Мэдди каждый раз создавала бы миллионы миров внутри миллионов миров. Скорее всего, обладая нужным исходным кодом и пройдя конкретную ключевую точку, а именно создание сферы Дайсона, Мэдди, думая что загружается в сферу, на самом деле выгружалась из симуляции в реальную сферу, где уже начинала с чистого листа снова создавать миры. Но из-за того, что она стёрла память, то не заметила разницы, так как всё идентично. А алгоритмы все сделали чисто и "бесшумно".
Финальный "Оберег" как бы является "контролером реальности". Он видит и прекрасно понимает, что происходит. Но, как высшее существо, позволяет Мэдди выбрать. Тема личного выбора не раз всплывает во втором сезоне. Тем не менее и Оберег не остался до конца в стороне, тоже вмешавшись и подтолкнув Мэдди к нужным действиям через Каспиана. Оберег каждый раз появляется, представляется заново и каждый раз приглашает в галактический совет, потому что не будь его, то цикл бы никогда не прерывался. Мэдди бы сама пришла к нужным выводам и без помощи оберега, также как это сделала исходная Мэдди. Но из-за внешнего вмешательства цикл прерывается и Мэдди выходит в реальность. Т.е. Оберег пытается высвободить Мэдди из её петли, но при этом каждый раз даёт выбор, тоже действуя аккуратно, чтобы не сказать лишнего и не повлиять на искренность её решения.
Ну и остаётся ещё вопрос, почему Мэдди, обладая сверх-разумом, сама не смогла понять, что застряла в петле. Возможно и догадалась. Но в момент триумфа, долгожданной встречи, Мэдди каждый раз поддаётся ностальгии, старым чувствам, т.к. ностальгия заложена в исправляющем изъян патче. Без неё она не была бы человеком. И она каждый раз выбирает жизнь, чувства и любовь, а Оберег каждый раз терпеливо ждёт новой возможности вытянуть Мэдди из петли. Потому что содержит в себе также и "исходного" Каспиана, которого поглотил 43 млн лет назад. И эта его часть всегда будет испытывать привязанность к Мэдди.
Вот и получается очень романтичная развязка, где каждый из "исходных" влюблённых пытается воссоединится со своей половинкой, но по своему и своим путём.
Такая вот бесконечно грустная история...