Чет все невпопад. В Bioshock с огромной долей вероятности специально сделали не "шутерную" механику стрельбы, ибо да, это не просто шутан (очень была важна небольшая дистанция влияния игрока на окружение и персонажей, использование плазмидов как важнейшей части игры). В Mafia получилось так, как получилось. Как и куча игр того времени, которые часто были недружелюбны в управлении (примеров очень много). Про Minecraft ваще промолчу. А случай с RE называется приемом акцентирования внимания и это нифига не бред разработчиков, а часть геймдизайна. Причем это целая наука, как в игре акцентировать внимание игрока, при этом не сильно выбить акцент из общего стиля. И так же, примеров куча.