Буквально на днях узнал что это из-за того что Харви Смиту идея сделать систему морали пришла уже под самый конец разработки, и Аркейны в спешке перелопачивали всю игру за несколько месяцев до релиза.

Впрочем я особо не вижу проблемы: дисхоноред настолько балдежная что после мясного прохождения сразу перезапускаешь игру и идёшь получать ачивку "чистые руки". Или наоборот.
Деус Эксы тоже кстати так проходятся, особенно с новой игрой плюс.