У меня эта началось когда поставил моды. Игру сейчас можно модифицировать положив файлы как в директорию игры так и в папку "%UserProfile%\Documents\My Games\Starfield\Data" + нужно внести изменения в файл StarfieldCustom.ini и если я правильно понял из за этих строк игра может некорректно читать сторонние файлы если они лежат и там и там. Так что я вытащил перевод в папку "%UserProfile%\Documents\My Games\Starfield\Data" к модам и квадраты ушли