Они не то чтобы респаунятся. На старых локациях просто появляются новые враги по мере прогрессии. Если их убить, то локация будет чиста до следующего подобного сюжетного триггера.
Но справедливости ради скажу, что без них играть было бы скучнее

А я за эти же две вещи игру люблю.