Я не анимешник, но это, вроде, чтоб эмоции передавать лучше и всё такое. Бегло где-то читал, что там даже характеры персонажей часто привязывают к размеру/форме глаз.
Ну и, к тому же вероятно, что это просто своеобразная традиция уже для жанра.