Ох, что за ересь про загрузочные флешки и прочие акронисы понаписали? Зачем? Подключаешь hdd к компу (да хоть на горячую). С вероятностью 99% загрузится та система, которая и была, т.е. с ssd, либо предложит выбор. Если нет, выбрать её через бут меню в биосе. Форматируешь hdd. Лучше через администрирование>управления дисками, с удалением всех разделов и созданием нового.