Да, они должны немного вылезать, если за них потянуть, они же не прикручиваются намертво к конструкции, а вставляются в неё. Вот, если бы они этого не делали, вот тогда было бы очень странно и стоило обеспокоиться о исправности геймпада в целом и стиков в частности.