Может ли размагничиваться/портиться жесткий диск установленный на дне корпуса ПК? Корпус металлический и магнититься. Жесткий диск установлен вверх крышкой.

Нет

Должен быть очень существенный магнит рядом, чтобы влиять на работу дисков. У корпуса вообще своего магнетизма быть не должно.