иногда вы будете находить ключевые предметы не по порядку или натыкаться на задание необычным способом

Это лучше, чем закрывать доступ к квестовой пещере каменной стеной или оставлять её пустой, пока нужное задание не выдадут.
Самая простая и удобная система была в Готике 3 (не помню, перенеслось ли это в Risen'ы). Игре было пофигу есть у тебя квест, или нет - убил трех именных кабанов или пять волков, получи запись в дневнике об удачном выполнении задания и шуруй искать квестодателя, чтобы награду забрать :)