По официальным данным правительства Таджикистана, в ходе пятилетней войны погибло свыше 60 тысяч человек. По состоянию на декабрь 2013 года не идентифицированы 42 братские могилы, расположенные преимущественно в центральной и западной частях страны. Кроме того, несколько тысяч человек пропали без вести.