Ограничение на ext4 в игровом режиме это действительно искусственное ограничение захардкоженое в скрипте автомонтирования.
steamdeck поддерживает множество других фс, и при желании можно даже использовать современные btrfs или f2fs, однако семейство fat это худший из вариантов, так как она не журналируемая, и при горячем извлечении(что обычно происходит с sd картой) вполне можно побить фс и потерять файлы, и откровенно глупо плакать что тебе не позволяют выстрелить себе в ногу