Очевидно, при проверке лицензий система отдаёт предпочтение апгрейду режиссёрской версии, которая фактически заместила собой пробную версию игры (ПЦ: Легенды). Дыра системы в том, что она вообще позволила эту пробную версию приобрести при наличии на аккаунте более полной (хоть и неполноценной ввиду требования диска). Ситуация патовая, "починить" её едва ли возможно, потому что сломана она на уровне ядра магазина (лицензии конфликтуют друг с другом), и проблему эту должны решать ведущие инженеры и программисты, а не операторы поддержки.
Вижу одно решение: всеми силами добиваться отмены второго заказа (возможно, создать новое обращение, ибо в этом общение зашло в тупик), а на просьбы предоставить чек на покупку диска вежливо слать оператора на хрен, потому что диск с базовой версией игры не имеет никакого отношения к купленному контенту, к которому у вас нет доступа. После этого надо будет (если останется желание играть) либо купить цифровую версию базовой игры (не факт, что такая возможность есть/будет), либо купить диск с этой базовой версией: тогда пазл сложится, и ваша лицензия станет вновь полноценной.
В теории лицензия "ПЦ: Легенды" может заработать при удалении лицензии апгрейда до режиссёрской версии, но эту покупку вам вряд ли отменят, ибо вы этим контентом пользовались, когда играли с диска, да и не факт, что рефанд подразумевает полное удаление лицензии с учётки, а не просто приостановку её действия.