Убежища и эксперименты, развитие темы гулификации, судьба всеми любимых фракций, большой пласт знаний о мире до Войны, откуда взялся Волт-Бой, изменения и добавления различных мелочей. Но самое главное - раскрылся антагонист всей франшизы, развязавший ядерную войну.