Сам геймдизайнер утверждает, что при разработке дизайна студии он вдохновлялся студией Media Molecule. Офис изначально создавался с прицелом на 100 сотрудников, а основной задачей было создать место, в котором людям было бы максимально комфортно работать и общаться.

Kojima Productions выполнена как оупенспейс: почти все сотрудники трудятся в одном помещении, отдельных офисов всего три, один из которых занимает сам Кодзима. У разработчиков есть собственная студия записи звука и помещение для 3D-сканирования.