Знаете, когда открываешь ссылку в gmail или skype то открывается браузерное окно. Чтобы открыть в самом Safari нужно нажать на кнопку внизу.
Есть приложенька opener кажется, она линкует ссылки как надо
Посмотрел. Там сказано что оно может открывать ссылки из веба в приложениях. Полезно, но не совсем то.