Да, загрузчик на хдд частая проблема. Я вообще не понимаю какого хрена виндовс пытается туда эти несчастные 100 мегабайт засунуть. Сам отключаю все диски, кроме того который нужно, перед установкой. Это единственный вариант 100% баг не словить.