Отсылка, обнаруженная игроками, намекает на появление в игре расы кварианцев, исполнивших важную роль в событиях оригинальной трилогии. Несмотря на то, что инопланетян, скрывающих свой истинный облик, не было в Andromeda, информация об их потерянном ковчеге появлялась в начале сюжетной кампании.