Была такая же проблема, поменял наушники на USB уши и стало ОК. У друга сейчас такая же проблема, как мы поняли софтом это не лечится и видимо проблема в самих портах. Через USB такой проблемы нет вроде как, но проверить стоит все же. А и еще как вариант взять отдельный микрофон, что бы и уши и микрофон не были единой конструкцией.